Ion Torrent PGM测序
实验流程:文库制备—数字PCR—芯片测序—数据分析。如:针对50个肿瘤相关基因的207个常见突变区域设计引物,在同一管中进行多重PCR,随后纯化扩增产物,利用PGM进行seq分析
ChIP-Seq
ChIP-Seq采用特异抗体对目的蛋白进行免疫沉淀,对其进行纯化和文库构建,再通过高通量测序,在全基因组范围内寻找目的蛋白的DNA结合位点,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA。
甲基化测序(RRBS)
RRBS(Reduced Representation Bisulfite Sequencing) 利用限制性内切酶对基因组进行酶切,可以极大幅度的提高CpG区域的测序深度。