「拨云见日」① | 茶叶样本植物代谢组实测数据大公开-自主发布-资讯-生物在线

「拨云见日」① | 茶叶样本植物代谢组实测数据大公开

作者:上海阿趣生物科技有限公司 2023-03-10T15:04 (访问量:7427)

植物代谢组是以植物为研究对象的代谢组学,研究不同物种、不同基因类型或不同生态类型的植物在不同生长时期或受某种刺激前后的所有小分子代谢产物,对其进行定性、定量分析,并找出代谢变化的规律。

百趣2022年植物领域重磅产品植物代谢组,自问世以来备受研究学者关注。那么它具有哪些优势呢?

优势一高品质海量植物数据库

植物代谢组具有包含20000+种植物初、次级代谢物,囊括近20000种植物且超98%代谢物具有参考文献来源的全新的、高品质的、海量的植物专属数据库。

优势二专业且科学的物质分类植物代谢组数据库是物质分类覆盖三个层级,分类更加科学且专业,从7个一级分类到400+的三级分类,提供了全面的、多层级的物质分类,可满足不同研究者对于物质分类细致程度不同的需求。

优势三

数据质量优,检出水平高

植物代谢组采用OE超高分辨质谱检测,超高质量精度辅助定性,同时高分辨可更好降低复杂基质中质量数接近的物质的干扰,使得定量更准确。

采用植物代谢组的组学技术对不同的物种进行检测,可定性到1000-1400种代谢物,如不同种类茶叶样本平均检出近1300种代谢物。我们知道在植物中,物种和组织部位间具有很大的代谢差异。

因此,我们将按照样本的物种、组织类型等进行植物代谢组实测数据的大公开。

数据大公开:【茶叶样本】植物代谢组检测数据多维展示

本周,我们看一看植物代谢组在经典样本类型——茶叶检测中的表现。

代谢物检出水平:高

我们可以发现,来自不同产地的不同种类茶叶的平均物质检出在1300左右,有的检出甚至高达1600+。

代谢物检出类别:广

检出数量在茶叶样本类型中的精彩展现已然绚丽,但更吸引人的在这里,我们对以上6种茶叶的检出代谢物的物质类别分析发现:

在所有茶叶样本中的初级代谢物(如碳水化合物、脂肪酸、氨基酸及短肽)检出为200种左右,而次级代谢物检出基本维持在800+种。

了解了实测结果中次级代谢物占比高,那么其主要覆盖了哪些具体类别呢?接下来我们以莽草酸及苯丙酸类、萜类为例揭示所覆盖的次级代谢物的具体类别。

我们可以看出莽草酸及苯丙酸类又可以分为黄酮、异黄酮、酚酸、香豆素、木脂素等类别,其中黄酮类、香豆素类别占比较高,而黄酮类中黄酮醇占比最高。

实测结果中萜类可以分为倍半萜、单萜类、萜类等,其中倍半萜类物质在萜类中占比较高,对单萜类进行三级分类分析发现薄荷酮类单萜占比较高。

从以上茶叶样本的二级、三级分类上来看,次级检测代谢物覆盖类别非常丰富。所有的类别代谢物在不同的种类茶叶中都是有差异的,因此对于代谢物的检测不能仅限于某一类,最好能覆盖到所有的类型。

当然,以上的数据仅为不同种类茶叶样本项目的实测数据,也不等于最终您样品中的检出情况。针对不同的处理,不同的生长条件,不同的品种,以上数据都有差异,因此我们需要根据自己的样品来进行实际分析。

代谢物数据分析内容:全 植物代谢组20+项数据分析内容可分为基础数据分析与高级数据分析,覆盖了从差异代谢物筛选到差异代谢物的功能分析的由浅入深式有用信息挖掘,为您带来更为全面细致的数据挖掘体验。

分析内容一览图

代谢物数据分析内容:丰富 20+项数据分析内容,无论是差异代谢物筛选的火山图还是差异代谢物功能分析的差异代谢物调控网络分析图,植物代谢组无一例外都带来了精美且符合发文需求的数据分析图。接下来将为您具体举例:

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K-Means图

KEGG分类图

差异丰度得分图

看完植物代谢组在不同种类茶叶中的精彩表现您心动了吗?现在联系我们,我们将会针对您的科研课题提供一对一的专属技术服务。

本期关于茶叶样本植物代谢组实测数据的分享就到这里结束啦~本系列推文共8期,第二期是什么样本类型呢?让我们一起期待一下!

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